MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica7 chromosome

Total Repeats: 34872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017361	A	6	6	2	7	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017361	T	6	6	35	40	0 %	100 %	0 %	0 %	385221505
3	NC_017361	TGA	3	9	121	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221505
4	NC_017361	TG	3	6	138	143	0 %	50 %	50 %	0 %	385221505
5	NC_017361	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	385221505
6	NC_017361	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221505
7	NC_017361	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	385221505
8	NC_017361	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	385221505
9	NC_017361	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221505
10	NC_017361	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385221505
11	NC_017361	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	385221505
12	NC_017361	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221506
13	NC_017361	TGT	2	6	536	541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221506
14	NC_017361	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	385221506
15	NC_017361	CT	3	6	691	696	0 %	50 %	0 %	50 %	385221506
16	NC_017361	CAAT	2	8	787	794	50 %	25 %	0 %	25 %	385221506
17	NC_017361	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221506
18	NC_017361	CTGT	2	8	811	818	0 %	50 %	25 %	25 %	385221506
19	NC_017361	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385221507
20	NC_017361	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221507
21	NC_017361	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221507
22	NC_017361	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385221507
23	NC_017361	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221507
24	NC_017361	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	385221507
25	NC_017361	TAA	2	6	1358	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221507
26	NC_017361	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385221507
27	NC_017361	T	6	6	1657	1662	0 %	100 %	0 %	0 %	385221507
28	NC_017361	T	6	6	1707	1712	0 %	100 %	0 %	0 %	385221507
29	NC_017361	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221508
30	NC_017361	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	385221508
31	NC_017361	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385221508
32	NC_017361	TAT	2	6	1822	1827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221508
33	NC_017361	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	385221508
34	NC_017361	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221508
35	NC_017361	GCT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221508
36	NC_017361	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221508
37	NC_017361	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221508
38	NC_017361	TCA	3	9	2051	2059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221508
39	NC_017361	ATA	2	6	2105	2110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221508
40	NC_017361	CATG	2	8	2127	2134	25 %	25 %	25 %	25 %	385221508
41	NC_017361	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385221508
42	NC_017361	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	385221508
43	NC_017361	TTC	2	6	2458	2463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017361	GGA	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385221509
45	NC_017361	A	7	7	2543	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	385221509
46	NC_017361	CTTT	2	8	2557	2564	0 %	75 %	0 %	25 %	385221509
47	NC_017361	T	7	7	2636	2642	0 %	100 %	0 %	0 %	385221509
48	NC_017361	AG	3	6	2653	2658	50 %	0 %	50 %	0 %	385221509
49	NC_017361	T	7	7	2678	2684	0 %	100 %	0 %	0 %	385221509
50	NC_017361	TGC	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221509
51	NC_017361	AGC	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221509
52	NC_017361	A	6	6	2827	2832	100 %	0 %	0 %	0 %	385221509
53	NC_017361	AG	3	6	2946	2951	50 %	0 %	50 %	0 %	385221509
54	NC_017361	GTG	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221509
55	NC_017361	AGA	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385221509
56	NC_017361	CAAA	2	8	3099	3106	75 %	0 %	0 %	25 %	385221509
57	NC_017361	GTG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221509
58	NC_017361	GCC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385221509
59	NC_017361	TGC	2	6	3215	3220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221510
60	NC_017361	GAAA	2	8	3245	3252	75 %	0 %	25 %	0 %	385221510
61	NC_017361	GAAA	2	8	3320	3327	75 %	0 %	25 %	0 %	385221510
62	NC_017361	GTT	2	6	3596	3601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221510
63	NC_017361	ATC	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221510
64	NC_017361	A	6	6	3864	3869	100 %	0 %	0 %	0 %	385221510
65	NC_017361	ATT	2	6	3904	3909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221510
66	NC_017361	TGT	2	6	3915	3920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221510
67	NC_017361	GGC	2	6	3977	3982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385221510
68	NC_017361	GGT	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017361	TAT	2	6	4131	4136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017361	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017361	TGG	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017361	GTG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017361	ACC	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017361	GGT	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017361	T	8	8	4604	4611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017361	TAG	2	6	4689	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017361	CAT	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017361	AAAC	2	8	4743	4750	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017361	TTG	2	6	4758	4763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017361	TTG	2	6	4768	4773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017361	A	6	6	4787	4792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017361	GTTTT	2	10	4793	4802	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017361	TTA	2	6	4813	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017361	T	6	6	4830	4835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017361	A	6	6	4836	4841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017361	A	6	6	4852	4857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017361	GATTT	2	10	4888	4897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017361	T	7	7	4912	4918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017361	A	6	6	4939	4944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017361	G	6	6	4963	4968	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017361	T	6	6	5013	5018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017361	T	7	7	5046	5052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017361	TTG	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017361	A	6	6	5065	5070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017361	TTTGT	2	10	5113	5122	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017361	AAAAAG	2	12	5166	5177	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017361	C	6	6	5184	5189	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_017361	AG	3	6	5194	5199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017361	A	9	9	5205	5213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017361	A	6	6	5220	5225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017361	C	6	6	5230	5235	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_017361	AAAG	2	8	5238	5245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017361	A	6	6	5264	5269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017361	CCATG	2	10	5401	5410	20 %	20 %	20 %	40 %	385221511
105	NC_017361	TCGC	2	8	5424	5431	0 %	25 %	25 %	50 %	385221511
106	NC_017361	ATTC	2	8	5453	5460	25 %	50 %	0 %	25 %	385221511
107	NC_017361	CATT	2	8	5497	5504	25 %	50 %	0 %	25 %	385221511
108	NC_017361	GAAA	2	8	5597	5604	75 %	0 %	25 %	0 %	385221511
109	NC_017361	TGG	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221511
110	NC_017361	TGA	2	6	5632	5637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385221511
111	NC_017361	A	6	6	5694	5699	100 %	0 %	0 %	0 %	385221511
112	NC_017361	A	6	6	5729	5734	100 %	0 %	0 %	0 %	385221511
113	NC_017361	CTT	2	6	5757	5762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385221511
114	NC_017361	T	6	6	5761	5766	0 %	100 %	0 %	0 %	385221511
115	NC_017361	GTT	2	6	5819	5824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221511
116	NC_017361	TAA	2	6	5888	5893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385221511
117	NC_017361	TTGAT	2	10	5913	5922	20 %	60 %	20 %	0 %	385221511
118	NC_017361	TTA	2	6	5946	5951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385221511
119	NC_017361	GTG	2	6	6015	6020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385221511
120	NC_017361	GC	3	6	6077	6082	0 %	0 %	50 %	50 %	385221511
121	NC_017361	TGT	2	6	6136	6141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221511
122	NC_017361	TTTGA	2	10	6290	6299	20 %	60 %	20 %	0 %	385221511
123	NC_017361	GCTTGC	2	12	6321	6332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385221511
124	NC_017361	CAG	2	6	6367	6372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221511
125	NC_017361	GCG	2	6	6394	6399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385221511
126	NC_017361	TTGCT	2	10	6408	6417	0 %	60 %	20 %	20 %	385221511
127	NC_017361	CGA	2	6	6445	6450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221511
128	NC_017361	T	6	6	6664	6669	0 %	100 %	0 %	0 %	385221511
129	NC_017361	TGT	2	6	6679	6684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221511
130	NC_017361	CTA	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385221511
131	NC_017361	CCG	2	6	6744	6749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385221511
132	NC_017361	CAG	2	6	6757	6762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385221511
133	NC_017361	TTTG	2	8	6763	6770	0 %	75 %	25 %	0 %	385221511
134	NC_017361	GTAGGT	2	12	6776	6787	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385221511
135	NC_017361	CCG	2	6	7057	7062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385221511
136	NC_017361	ATCG	2	8	7145	7152	25 %	25 %	25 %	25 %	385221511
137	NC_017361	CGTT	2	8	7180	7187	0 %	50 %	25 %	25 %	385221511
138	NC_017361	GTT	2	6	7202	7207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385221511
139	NC_017361	T	6	6	7253	7258	0 %	100 %	0 %	0 %	385221511
140	NC_017361	A	6	6	7319	7324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017361	GA	7	14	7358	7371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017361	AGT	2	6	7377	7382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017361	T	7	7	7382	7388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017361	AAATT	2	10	7406	7415	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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